Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CENPEQ02224 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms