Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MDM2Q00987 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms