Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF9Q00978 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRF9Q00978 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms