Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM193AP78312 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms