Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMSP52788 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMSP52788 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMSP52788 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMSP52788 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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