Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NEK3P51956 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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