Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRXP46100 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRXP46100 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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