Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RECQLP46063 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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