Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMPOP42166 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms