Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms