Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms