Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNMT1P26358 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms