Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PTPRBP23467 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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