Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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