Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2RAP15509 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms