Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXB3P14651 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms