Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBSLP0DN79 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBSLP0DN79 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBSLP0DN79 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBSLP0DN79 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms