Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEBLO76041 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEBLO76041 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEBLO76041 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEBLO76041 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEBLO76041 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms