Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EDIL3O43854 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EDIL3O43854 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms