Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F3O00716 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F3O00716 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F3O00716 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms