Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms