Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PATL2C9JE40 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms