Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-2B6SEH9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-2B6SEH9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms