Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms