Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms