Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH7Q9ULB5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms