Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNX15Q9NRS6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms