Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms