Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms