Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PNPLA8Q9NP80 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms