Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCP2Q9BX26 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP2Q9BX26 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms