Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms