Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC97Q96F63 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms