Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHFRQ96EP1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHFRQ96EP1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms