Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN23Q96B33 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN23Q96B33 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN23Q96B33 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN23Q96B33 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN23Q96B33 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN23Q96B33 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CLDN23Q96B33 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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