Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms