Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRAMD4Q6IC98 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms