Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DENND4CQ5VZ89 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms