Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms