Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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COL24A1Q17RW2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL24A1Q17RW2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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