Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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