Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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