Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFIXQ14938 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms