Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSC3Q14574 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms