Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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