Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN3Q13064 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN3Q13064 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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