Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC18A2Q05940 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms