Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN1Q04323 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms