Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms