Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms